Ошибка при обучении модели

Добрый день! Пытаюсь таким образом обучить модель:

from deeppavlov import configs, train_model
from deeppavlov.core.commands.utils import parse_config

config_dict['dataset_reader']['data_path'] = '/Jdrey/PyNet/testLoad/train_pavlov_files/'
ner_ontonotes_model = train_model(configs.ner.ner_ontonotes_bert)

Получаю ошибку :

   2020-03-12 16:10:12.849 INFO in 'deeppavlov.core.trainers.fit_trainer'['fit_trainer'] at line 68: NNTrainer got additional init parameters ['pytest_max_batches', 'pytest_batch_size'] that will be ignored:
WARNING:tensorflow:From d:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\trainers\nn_trainer.py:149: The name tf.summary.FileWriter is deprecated. Please use tf.compat.v1.summary.FileWriter instead.


    Ядро остановилось, перезапуск

Гугл ничего полезного не дал. Что-то можете подсказать?

Нужен трейсбек чтобы понять в чём дело, можете положить этот код в отдельный скрипт и запустить его? Ну и соответственно трейсбек показать.

я полностью приложила всё, что есть.
файл содержит только :

from deeppavlov import configs, train_model
from deeppavlov.core.commands.utils import parse_config

config_dict = parse_config(configs.ner.ner_ontonotes_bert)

config_dict['dataset_reader']['data_path'] = '/Jdrey/PyNet/testLoad/train_pavlov_files/'

ner_ontonotes_model = train_model(configs.ner.ner_ontonotes_bert)

Весь лог:

runfile('D:/Jdrey/PyNet/testLoad/train_pavlov.py', wdir='D:/Jdrey/PyNet/testLoad')
2020-03-12 16:42:58.413 INFO in 'deeppavlov.core.trainers.fit_trainer'['fit_trainer'] at line 68: NNTrainer got additional init parameters ['pytest_max_batches', 'pytest_batch_size'] that will be ignored:
WARNING:tensorflow:From d:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\trainers\nn_trainer.py:149: The name tf.summary.FileWriter is deprecated. Please use tf.compat.v1.summary.FileWriter instead.

WARNING:tensorflow:From d:\anaconda\lib\site-packages\bert_dp\tokenization.py:125: The name tf.gfile.GFile is deprecated. Please use tf.io.gfile.GFile instead.


Ядро остановилось, перезапуск

Данные для обучения :

    разведочная O
    площадь O
    Тас B-GPE
    - I-GPE
    Юряхская I-GPE
    . O

    разведочная O
    площадь O
    Юдоконская B-GPE
    . O

Это jupyter? Если да, то было бы интересно увидеть следующее:
код положить в test_ner.py, и сделать python test_ner.py.
Еще может быть полезно узнать вывод команды pip list в терминале и есть ли GPU или нет.

Это Spyder (Anaconda).

Лог запуска из командной строки :

D:\Jdrey\PyNet\testLoad>python train_pavlov.py >>log.lst
2020-03-13 11:47:32.754 INFO in 'deeppavlov.core.trainers.fit_trainer'['fit_trainer'] at line 68: NNTrainer got additional init parameters ['pytest_max_batches', 'pytest_batch_size'] that will be ignored:
WARNING:tensorflow:From D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\trainers\nn_trainer.py:149: The name tf.summary.FileWriter is deprecated. Please use tf.compat.v1.summary.FileWriter instead.

Traceback (most recent call last):
  File "train_pavlov.py", line 15, in <module>
    ner_ontonotes_model = train_model(configs.ner.ner_ontonotes_bert)
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\__init__.py", line 32, in train_model
    train_evaluate_model_from_config(config, download=download, recursive=recursive)
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\commands\train.py", line 121, in train_evaluate_model_from_config
    trainer.train(iterator)
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\trainers\nn_trainer.py", line 333, in train
    self.fit_chainer(iterator)
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\trainers\fit_trainer.py", line 104, in fit_chainer                                                                                                      11:49
    component = from_params(component_config, mode='train')
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\common\params.py", line 95, in from_params
    obj = get_model(cls_name)
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\common\registry.py", line 72, in get_model
    return cls_from_str(_REGISTRY[name])
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\core\common\registry.py", line 40, in cls_from_str
    return getattr(importlib.import_module(module_name), cls_name)
  File "D:\anaconda\lib\importlib\__init__.py", line 127, in import_module
    return _bootstrap._gcd_import(name[level:], package, level)
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 1006, in _gcd_import
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 983, in _find_and_load
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 953, in _find_and_load_unlocked
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 219, in _call_with_frames_removed
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 1006, in _gcd_import
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 983, in _find_and_load
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 953, in _find_and_load_unlocked
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 219, in _call_with_frames_removed
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 1006, in _gcd_import
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 983, in _find_and_load
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 967, in _find_and_load_unlocked
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 677, in _load_unlocked
  File "<frozen importlib._bootstrap_external>", line 728, in exec_module
  File "<frozen importlib._bootstrap>", line 219, in _call_with_frames_removed
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\deeppavlov\models\__init__.py", line 17, in <module>
    import nltk
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\__init__.py", line 150, in <module>
    from nltk.translate import *
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\translate\__init__.py", line 23, in <module>
    from nltk.translate.meteor_score import meteor_score as meteor
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\translate\meteor_score.py", line 10, in <module>
    from nltk.stem.porter import PorterStemmer
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\stem\__init__.py", line 29, in <module>
    from nltk.stem.snowball import SnowballStemmer
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\stem\snowball.py", line 32, in <module>
    from nltk.corpus import stopwords
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\corpus\__init__.py", line 66, in <module>
    from nltk.corpus.reader import *
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\corpus\reader\__init__.py", line 105, in <module>
    from nltk.corpus.reader.panlex_lite import *
  File "D:\anaconda\lib\site-packages\nltk\corpus\reader\panlex_lite.py", line 15, in <module>
    import sqlite3
  File "D:\anaconda\lib\sqlite3\__init__.py", line 23, in <module>
    from sqlite3.dbapi2 import *
  File "D:\anaconda\lib\sqlite3\dbapi2.py", line 27, in <module>
    from _sqlite3 import *
ImportError: DLL load failed: Не найден указанный модуль.

То есть проблема в том, что требуется модуль _sqlite3 ?

pip list вернул :

Package                            Version           
---------------------------------- ------------------
absl-py                            0.9.0             
aio-pika                           6.4.1             
aiormq                             3.2.1             
alabaster                          0.7.12            
anaconda-client                    1.7.2             
anaconda-navigator                 1.9.7             
anaconda-project                   0.8.3             
asn1crypto                         1.0.1             
astor                              0.8.1             
astroid                            2.3.1             
astropy                            3.2.1             
atomicwrites                       1.3.0             
attrs                              19.2.0            
Babel                              2.7.0             
backcall                           0.1.0             
backports.functools-lru-cache      1.3               
backports.os                       0.1.1             
backports.shutil-get-terminal-size 1.0.0             
backports.tempfile                 1.0               
backports.weakref                  1.0.post1         
beautifulsoup4                     4.8.0             
bert-dp                            1.0               
bitarray                           1.0.1             
bkcharts                           0.2               
bleach                             3.1.0             
bokeh                              1.3.4             
boto                               2.49.0            
Bottleneck                         1.2.1             
cachetools                         4.0.0             
certifi                            2019.9.11         
cffi                               1.12.3            
chardet                            3.0.4             
Click                              7.0               
cloudpickle                        1.2.2             
clyent                             1.2.2             
colorama                           0.4.1             
comtypes                           1.1.7             
conda                              4.8.2             
conda-build                        3.18.9            
conda-package-handling             1.6.0             
conda-verify                       3.4.2             
contextlib2                        0.6.0             
cryptography                       2.8               
cycler                             0.10.0            
Cython                             0.29.14           
cytoolz                            0.10.0            
dask                               2.5.2             
DAWG-Python                        0.7.2             
decorator                          4.4.0             
deeppavlov                         0.8.0             
defusedxml                         0.6.0             
dill                               0.3.1.1           
distributed                        2.5.2             
docopt                             0.6.2             
docutils                           0.15.2            
docx2txt                           0.8               
entrypoints                        0.3               
et-xmlfile                         1.0.1             
fast-histogram                     0.7               
fastapi                            0.47.1            
fastcache                          1.1.0             
filelock                           3.0.12            
Flask                              1.1.1             
fsspec                             0.5.2             
future                             0.17.1            
fuzzywuzzy                         0.17.0            
gast                               0.2.2             
gevent                             1.4.0             
glob2                              0.7               
glue-core                          0.15.6            
glue-vispy-viewers                 0.12.2            
glueviz                            0.15.2            
google-auth                        1.10.0            
google-auth-oauthlib               0.4.1             
google-pasta                       0.1.8             
greenlet                           0.4.15            
grpcio                             1.26.0            
h11                                0.9.0             
h5py                               2.10.0            
HeapDict                           1.0.1             
html5lib                           1.0.1             
idna                               2.8               
imageio                            2.6.0             
imagesize                          1.1.0             
importlib-metadata                 0.23              
ipykernel                          5.1.2             
ipython                            7.8.0             
ipython-genutils                   0.2.0             
ipywidgets                         7.5.1             
isort                              4.3.21            
itsdangerous                       1.1.0             
jdcal                              1.4.1             
jedi                               0.15.1            
Jinja2                             2.10.3            
joblib                             0.13.2            
json5                              0.8.5             
jsonschema                         3.0.2             
jupyter                            1.0.0             
jupyter-client                     5.3.3             
jupyter-console                    6.0.0             
jupyter-core                       4.5.0             
jupyterlab                         1.1.4             
jupyterlab-server                  1.0.6             
Keras                              2.3.1             
Keras-Applications                 1.0.8             
Keras-Preprocessing                1.1.0             
keyring                            18.0.0            
kiwisolver                         1.1.0             
lazy-object-proxy                  1.4.2             
libarchive-c                       2.8               
llvmlite                           0.29.0            
locket                             0.2.0             
lxml                               4.4.1             
Markdown                           3.1.1             
MarkupSafe                         1.1.1             
matplotlib                         3.1.1             
mccabe                             0.6.1             
menuinst                           1.4.16            
mistune                            0.8.4             
mkl-fft                            1.0.14            
mkl-random                         1.1.0             
mkl-service                        2.3.0             
mock                               3.0.5             
more-itertools                     7.2.0             
mpl-scatter-density                0.6               
mpmath                             1.1.0             
msgpack                            0.6.1             
multidict                          4.7.5             
multipledispatch                   0.6.0             
natasha                            0.10.0            
navigator-updater                  0.2.1             
nbconvert                          5.6.0             
nbformat                           4.4.0             
networkx                           2.3               
nltk                               3.4.5             
nose                               1.3.7             
notebook                           6.0.1             
numba                              0.45.1            
numexpr                            2.7.0             
numpy                              1.18.0            
numpydoc                           0.9.1             
oauthlib                           3.1.0             
olefile                            0.46              
openpyxl                           3.0.0             
opt-einsum                         3.1.0             
overrides                          2.7.0             
packaging                          19.2              
pamqp                              2.3.0             
pandas                             0.25.3            
pandocfilters                      1.4.2             
parso                              0.5.1             
partd                              1.0.0             
path.py                            12.0.1            
pathlib2                           2.3.5             
patsy                              0.5.1             
pep8                               1.7.1             
pickleshare                        0.7.5             
Pillow                             6.2.0             
pip                                19.3.1            
pkginfo                            1.5.0.1           
plotly                             4.4.1             
pluggy                             0.13.0            
ply                                3.11              
prometheus-client                  0.7.1             
prompt-toolkit                     2.0.10            
protobuf                           3.11.2            
psutil                             5.6.3             
py                                 1.8.0             
pyasn1                             0.4.8             
pyasn1-modules                     0.2.7             
pybind11                           2.4.3             
pycodestyle                        2.5.0             
pycosat                            0.6.3             
pycparser                          2.19              
pycrypto                           2.6.1             
pycurl                             7.43.0.3          
pydantic                           1.3               
pyflakes                           2.1.1             
Pygments                           2.4.2             
pylint                             2.4.2             
pymorphy2                          0.8               
pymorphy2-dicts                    2.4.393442.3710985
pymorphy2-dicts-ru                 2.4.404381.4453942
pyodbc                             4.0.27            
PyOpenGL                           3.1.1a1           
pyOpenSSL                          19.1.0            
pyparsing                          2.4.2             
pyreadline                         2.1               
pyrsistent                         0.15.4            
PySocks                            1.7.1             
pyTelegramBotAPI                   3.6.7             
pytest                             5.2.1             
pytest-arraydiff                   0.3               
pytest-astropy                     0.5.0             
pytest-doctestplus                 0.4.0             
pytest-openfiles                   0.4.0             
pytest-remotedata                  0.3.2             
python-dateutil                    2.8.0             
python-docx                        0.8.10            
pytz                               2019.3            
PyWavelets                         1.0.3             
pywin32                            223               
pywinpty                           0.5.5             
PyYAML                             5.1.2             
pyzmq                              18.1.0            
QtAwesome                          0.6.0             
qtconsole                          4.5.5             
QtPy                               1.9.0             
requests                           2.22.0            
requests-oauthlib                  1.3.0             
retrying                           1.3.3             
rope                               0.14.0            
rsa                                4.0               
ruamel-yaml                        0.15.46           
rusenttokenize                     0.0.5             
scikit-image                       0.15.0            
scikit-learn                       0.21.2            
scipy                              1.4.1             
seaborn                            0.9.0             
Send2Trash                         1.5.0             
setuptools                         41.4.0            
simplegeneric                      0.8.1             
singledispatch                     3.4.0.3           
six                                1.12.0            
snowballstemmer                    2.0.0             
sortedcollections                  1.1.2             
sortedcontainers                   2.1.0             
soupsieve                          1.9.3             
Sphinx                             2.2.0             
sphinxcontrib-applehelp            1.0.1             
sphinxcontrib-devhelp              1.0.1             
sphinxcontrib-htmlhelp             1.0.2             
sphinxcontrib-jsmath               1.0.1             
sphinxcontrib-qthelp               1.0.2             
sphinxcontrib-serializinghtml      1.1.3             
sphinxcontrib-websupport           1.1.2             
spyder                             3.3.6             
spyder-kernels                     0.5.2             
SQLAlchemy                         1.3.9             
starlette                          0.12.9            
statsmodels                        0.10.1            
sympy                              1.4               
tables                             3.5.2             
tblib                              1.4.0             
tensorboard                        1.15.0            
tensorflow                         1.15.2            
tensorflow-estimator               1.15.1            
tensorflow-hub                     0.7.0             
termcolor                          1.1.0             
terminado                          0.8.2             
testpath                           0.4.2             
toolz                              0.10.0            
tornado                            6.0.3             
tqdm                               4.41.1            
traitlets                          4.3.3             
unicodecsv                         0.14.1            
urllib3                            1.24.2            
uvicorn                            0.11.1            
wcwidth                            0.1.7             
webencodings                       0.5.1             
websockets                         8.1               
Werkzeug                           0.16.0            
wheel                              0.33.6            
widgetsnbextension                 3.5.1             
win-inet-pton                      1.1.0             
win-unicode-console                0.5               
wincertstore                       0.2               
wrapt                              1.11.2            
xlrd                               1.2.0             
XlsxWriter                         1.2.1             
xlwings                            0.15.10           
xlwt                               1.3.0             
yargy                              0.12.0            
yarl                               1.4.2             
zict                               1.0.0             
zipp                               0.6.0             

Что касается GPU: отдельно я ничего не дописывала/настраивала. По умолчанию, вроде бы нет использования GPU?

Попробуйте решение из вот этого треда https://stackoverflow.com/questions/54876404/unable-to-import-sqlite3-using-anaconda-python

Спасибо, помогло!
Ещё вопрос (если он вообще имеет смысл, то вынесу в отдельный тред) : можно ли как-то ускорить шаг “2020-03-16 11:56:15.222 INFO in ‘deeppavlov.core.models.tf_model’[‘tf_model’] at line 51: [loading model from C:\Users\JDrey.deeppavlov\models\ner_ontonotes_bert\model]” ? до обучения длился 14 минут, после обучения (на 2 предложениях по 2 слова каждое) не хватило и 21 минуты на выполнение, прервалось по внешним причинам.